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患有普瑞德-威利综合征的成年人表现出一种独特的微生物群

摘要

客观的

与一般成年人相比,患有普瑞德-威利综合征(PWS)的成年人需要更少的能量摄入来维持体重。这一点,再加上它们改变的胃肠道转运时间,可能会影响微生物群的组成。该研究的目的是确定患有PWS的成年人的粪便微生物群组成是否与未受影响的成年人不同。使用常规饮食/非干预样本,使用16S rRNA基因扩增子测序分析粪便微生物群组成,并将来自PWS成人的数据与其他四个因地理位置和年龄不同而不同的成人队列合并。QIIME 2™样本分类器,机器学习算法用于交叉训练样本和预测从哪个数据集分类档案属于。提取所有数据集之间最具区别的类群,并对R库pirateplot进行可视化检查,以选择与PWS相关的丰度差异较大的类群。

结果

PWS成虫粪便微生物群组成较低Blautia增强的RF39(软质门),瘤胃球菌科,AlistipesErysipelotrichacaea,ParabacteriodesOdoribacter。特别是,高丰度的软质细菌可能是PWS微生物群的一个标志性特征,尽管其与代谢健康的关系(如果有的话)尚不清楚。

介绍

PRADER-WILLI综合征(PWS)是一种遗传障碍,其特征在于能量需求较低,缺乏饱腹感,少血管,如果食物摄入不严格控制1].虽然报告了总纤维摄入量的PWS [23.]类似于一般人群[4.,便秘在这一人群中很常见[5.].微生物群组合物可以通过便秘改变;证据表明减少了双歧杆菌属[6.7.],乳酸菌[7.),拟杆菌[6.]与健康对照相比。此外,还据报道,具有便秘 - 主要的肠易激综合征(IBS)的个体较低双歧杆菌属乳酸菌Spp .和更低Roseburia-E. Rectale.分类群和更高的硫酸盐减速剂[8.].然而,在女性中,粪便微生物群与便秘无关,而是与结肠传输时间相关[9.].与健康对照组相比,PWS成人的平均肠道通过时间延迟[5.],表明运动性问题可能影响微生物区系。

在成年PWS患者中,微生物群组成已被证明与年龄、性别和体脂质量指数匹配的对照组不同。具体来说,PWS患者有更高的Akkermansia脱磷孤菌属和淡针菌属和古生菌属的类群,但丰度较低Dorea.[10].然而,这些PWS受试者的微生物群组成与他们的亲本没有显著差异。目前尚不清楚PWS患者的微生物群组成是该综合征的特征还是该环境的特征。考虑到微生物群、其代谢和代谢健康之间的相互关系,PWS的微生物群分布被认为是一种过度吞噬模型[11,是有趣的。本探索性分析的目的是确定PWS成虫的微生物群组成是否与未受影响的成虫不同,独立于地理位置和年龄。

主要内容

方法

从25名成年人(34.9±10.2年;60%为女性)有遗传证实的PWS,居住在佛罗里达[3.12]与居住在加拿大的健康成年人进行了比较(n = 151;35.2±10.1年;61%女性)13]成年人居住在加拿大(n = 263; 41.8±15.2; 79%的女性)[14],居住在美国佛罗里达州的健康年轻人(n = 68;23.2±3.5;63%女性)15]和居住在佛罗里达的健康老年妇女(n = 26;73.7±5.6年)[16].所有源数据来源于相同的实验室环境,随后采用相同的生物信息学处理。DNA提取的详情[3.16[以前报道,通过16S扩增子样本的群体样本进行群体分类分析的群体分类分析的方法及其在源研究中进行的[3.],即本分析未进行DNA提取或测序。佛罗里达大学的机构审查委员会批准了这项对去识别的16S档案的分析作为豁免。fastq格式的数据被导入到一个QIIME工件(demux.qza) [17].所有reads都经过相同参数的质量过滤,并在240bp的前向reads上进行裁剪。利用去模糊去噪(作为qiime2模块实现),生成了扩增子序列变体(ASV)丰度表和代表性序列。将具有代表性的序列合并在一起,用分类学方法进行分类。qza接受了GreenGenes数据库的培训。丰度表中的asv被归为已知的分类名称,并在属水平上进行汇编,以便进一步分析。

使用QIIME的可视化工具,生成并检查了主坐标分析(PCoA)、加权UniFrac和单个分类剖面[17181920.21222324252627282930.313233343536].使用QIIME 2样本分类器突出了组间的差异。这个模块允许机器学习算法对样本进行交叉训练,并预测标签(这里的标签是“分类资料来自哪个数据集”)。提取算法所使用的重要特征(数据集之间区别最大的类群),并利用类群列表进行进一步的挖掘。每个重要的特性都使用R库PiratePlot (R版本3.5.3)绘制。由于该分类群列表并不是为了单独挑出PWS,而是为了区分所有数据集,因此我们对样地进行了可视化检查,以选择与PWS有显著差异的分类群。8种pws -特异分类群出现在前36个重要特征中。

结果

根据样本的临床试验来源,使用Emperor和颜色编码可视化合并数据集的QIIME加权UniFrac PCoA,如图所示。1.每个数据点代表一个粪便样本,它们之间的距离矩阵基于ASV计数和系统发育。PWS的样本似乎聚集在一起(右上部分),而其他的样本都显示出明显的重叠,这表明PWS的特征与其他成年人不同。相反,PWS概要文件具有其他组不共享的相似性。在此基础上,利用机器学习算法对样本来源轮廓进行分类,并突出最显式分类。数字2显示了在基线时采集的合并数据集样本上训练的Extra-Tree分类的机器学习模型精度结果。混淆矩阵在主对角线上显示出较强的准确率,总体准确率为74.8%,仅PWS预测的准确率为100%。培训以80-20%的培训-测试交叉验证比率进行。QIIME样本分类器模块热图可视化如图所示。2,描述用于分类的重要类群的相对丰度。

图1
图1

通过加权UniFrac主坐标分析(PCoA)对居住在加拿大的PWS和PWS成人粪便微生物组数据集进行Beta多样性分析;(B)居住在加拿大的成人肠易激综合征,(C)居住在美国佛罗里达的成年人,(D)居住在佛罗里达的老年妇女

图2
figure2

的所有分类阈值下机器学习分类模型的性能的Receiver Operating Characteristic (ROC)曲线1平均分数和2每班。模型优化曲线是假阳性率范围的真正阳性率。3.模型的准确性和4.合并数据集样本的额外树分类的总体和基线准确性为成年PWS和成年队列(A)居住在加拿大,(B)居住在加拿大,(C)居住在美国佛罗里达,(D)居住在佛罗里达的老年妇女。5.热图可视化显示从粪便样本的相对丰度的重要类群用于分类的成年Prader-Willi综合征与未受影响的成人组

重要类群的列表(和相关的重要性分数)从“feature_importance获得。qza '文件由分类器生成,用于绘制在附加文件中的单个分类单元1:图S1。请注意,该模型针对整体性能进行了优化,因此显示的36个重要特征分类群中的许多特征被模型用于区分非pws样本。通过人工可视化选择PWS解释类群(PWS与其他类群明显不同的类群图)表明,36个重要特征中有8个类群与PWS微生物区系剖面相关联(图1)。3.).在pws -特异的8个分类单元中,只有属Blautia(排名1)在PWS中低于其他队列。这是我们感兴趣的Blautia是所有数据集中最丰富的属,平均总样品组成的21%。在不同的分类水平下,喇叭喇叭患者出现了两次(等级8和12)。属Alistipes(家庭rikenellaceae,Phylum bercumetes)排名9,PWS显然高于其他一些。erysipelotrichacaea,Parabacteroides(家庭Porphyromonadaceae)和气味,在PWS数据集中分别在17,18和33中分别出现较高。最后,排名15是RF39(Phylum TernerCutes,Class Mollicutes)的顺序,它似乎与PWS密切相关,因为这种非受影响的成人队列样本中该分类群的相对丰度的最大值远低于PWS的最大值.注意,排名3(附加文件1:图S1)提示双歧杆菌属丰富的PWS型材类似于年长妇女,但比其他成人队列低。

图3
图3

8种植物相对丰度的海盗图1Genus.Blautia2家庭Ruminococcaceae3.Genus.Alistipes4.Genus.瘤胃球菌属5.订单RF396.家庭erysipelotrichaceae7.Genus.Parabacteroides,8.Genus.Oridobacter,通过手动,目视检查,代表Prader-Willi综合征(PWS)微生物群概况与居住在加拿大的成年人(B)的成年人(B)居住在加拿大(C)居住在佛罗里达州的成年人的成年人之间的表观差异,美国和(d)居住在佛罗里达州的老年妇女

讨论

以前的研究表明,具有PWS的成年人可能具有独特特征的微生物群组成[10].在本研究中,丰富的双歧杆菌属PWS水平较低,除了表现出类似低水平的老年女性。这一发现并不意外,因为抑制双歧杆菌属在便秘患者中有报道[7.]而一些有PWS的成年人报告了慢过境粪便形式,暗示便秘[3.].这一发现虽然给予了保护作用双歧杆菌属维持肠道真生和屏障功能[37].PWS成虫表现出更多的软质(RF39目),AlistipesParabacteroides,气味,以及瘤胃球菌科和丹毒杆菌科,与未受影响的成虫相比。有趣的是,RF39是Olssen等人在PWS成人中发现的分类群之一[10]和Peng等人。与匹配的控制相比,在PWS的儿童中[38].在PWS成人中高水平的淡状细胞的相关性尚不清楚;然而,丰富的AlistipesParabacteroides与血脂、血糖、血压等心脏代谢指标呈负相关[39].此外,瘤胃球菌科与代谢综合征呈负相关[40]和降低长期体重增加[41].相反,丹毒科的丰富度与肥胖和脂质代谢有关,而且该家族的特定分类群可能是炎症和免疫原性的[42].这两个气味Alistipes与饮食质量有关[43].Olsson等人的研究表明,成年PWS患者的脂肪丰度较低Dorea.与肥胖控制相比[10].同样,彭等人,通过随机森林分析,也确定了差异Dorea.与控制相比,在PWS的儿童[38].Dorea.不是本研究中PWS的识别分类群。然而,在该分析中具有PWS的成年人具有较低的体重指数(BMI)[3.]比奥尔森研究的主题。较低的丰富Blautia在具有PWS的成年人中作为一个有趣的谜。Lachnospiraceae家族中的三个属性已被证明与BMI呈正相关,即BlautiaDorea.,瘤胃球菌属[44].Blautia在调整了年龄、BMI和其他与生活方式相关的因素后,脂肪含量已被证明与内脏脂肪面积呈负相关[45].与健康成年人相比,含有较低的内脏脂肪区域的PWS的成年人[46],这被认为有助于他们降低发展2型糖尿病的风险[47].因此,考虑到他们的体重状况和通常较低的内脏脂肪,可以预计PWS患者会有更高的丰度Blautia.值得注意的是,Blautia丰度还与血清胰岛素升高和脂质代谢受损有关[48,表明低丰度的好处。更低水平的Blautia因此,尽管经常肥胖,但成年PWS患者的胰岛素敏感性可能与其相关。总之,微生物群研究结果可能提示PWS的心脏代谢保护相关的益处[47].

Blautia仕达屋优先计划利用膳食碳水化合物[49],从而限制PWS成人的碳水化合物摄入量[3.可能导致了更低的Blautia丰富。较低的丰富Blautia与久入控制相比,在食用更高的蛋白质,降低碳水化合物饮食的运动员中显示出[50].虽然成年PWS患者的蛋白质、脂肪和碳水化合物的绝对摄入量只是运动员摄入量的一小部分,但蛋白质能量的百分比是相似的[3.,因此常量营养素组成可能有助于Blautia丰富。然而,蛋白质、脂肪、碳水化合物或纤维的摄入与Blautia在一项大型横断面研究中发现了丰富的物质[45].更有趣的是Blautia丰富和胃肠道症状。IBS患者,其胃肠道症状减轻低fodmap饮食,有更高的丰度Blautia[51,表明这些人有内脏敏感性。相反,PWS患者对疼痛和不适表现出较高的耐受性[52].为该分析提供粪便样本的成年PWS患者报告有轻微的胃肠道不适[3.,类似于健康的人[1553].关系的可能性Blautia丰度和内脏敏感度需要进一步研究。

该分析的结果提供了进一步的证据表明,具有PWS的个体的微生物群组成与未受影响的个体的微生物群组成不同,特别是在具有更高的双限的存在,特别是订单RF39,尽管对健康的影响是未知的。此外,探索之间的关系可能很有意思BlautiaPWS和其他患者群体的丰度和内脏敏感性以及代谢健康。鉴于它们的低流行率双歧杆菌属, PWS群体可能受益于共生补充。

限制

这项研究有局限性。最重要的是,这项研究是作为HOC分析进行的。其主要限制是使用合并的数据集进行PWS对非受影响成人的比较,因为粪便样本未在同一批次中处理。然而,所有样品都在收集,储存,排序和生物信息学方面使用完全相同的方法处理。使用单个数据库,Greengenes;如果使用其他数据库(如Silva)分析数据,结果可能有所不同。

数据和材料的可用性

PWS成人的数据集可在以下网址获得:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/?term=PRJNA669563.本研究生成并分析的完整数据集不对外公开,但经相应作者合理请求可获得已识别的数据。

缩写

体重指数:

身体质量指数

肠易激综合症:

肠易激综合症

PCoA:

主坐标分析

浆:

PRADER-WILLI综合症

参考

  1. 1.

    Butler Mg,Miller JL,Forster JL。PRADER-WILLI综合征 - 临床遗传学,诊断和治疗方法:更新。2019年Curr Pedias Rev.15(4):207-44。https://doi.org/10.2174/1573396315666190716120925

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  2. 2.

    关键词:木材,木材,木材,木材,木材,木材普瑞德-威利综合征成年人的饮食和身体活动与身体组成和定时步行距离之间的关系。Food Nutr Res. 2018。https://doi.org/10.29219/fnr.v62.1343

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  3. 3.

    Alyousif Z,Miller JL,螺旋钻J,Sandoval M,Piano A,Tompkins Ta,等。PRADER-WILLI综合征影响的成年人百分比百分比益生菌补充的疗效和疗效:随机,双盲,交叉试验。Mol Genet Genom Med。2020。https://doi.org/10.1002/mgg3.1535

    文章谷歌学术搜索

  4. 4.

    Reicks M, Jonnalagadda S, Albertson AM, Joshi N.美国人口总膳食纤维摄入量与全谷物消费相关:2009 - 2010年国家健康和营养检查调查结果。减轻杂志2014;34(3):226 - 34。https://doi.org/10.1016/j.nutres.2014.01.002

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  5. 5.

    一项关于成年prer - willi综合征患者结肠直肠功能的描述性研究:便秘的高发病率。BMC杂志。2014;14:63。https://doi.org/10.1186/1471-230X-14-63

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  6. 6.

    Kim SE, Choi SC, Park KS, Park MI, Shin JE, Lee TH,等。VSL#3型益生菌短期治疗功能性便秘患者粪便菌群变化及疗效观察。神经胃肠病杂志。2015;21(1):111-20。https://doi.org/10.5056/jnm14048

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  7. 7.

    Khalif IL, Quigley EM, Konovitch EA, Maximova ID。慢性便秘结肠菌群和肠道通透性的改变和免疫激活的证据。肝脏病学杂志。2005;37(11):838-49。https://doi.org/10.1016/j.dld.2005.06.008

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  8. 8.

    关键词:碳纳米管,碳纳米管,碳纳米管,碳纳米管便秘-肠易激综合征患者肠道菌群的功能失调药物治疗学。2012;35(7):828-38。https://doi.org/10.1111/j.1365-2036.2012.05007.x.

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  9. 9.

    Parthasarathy G,Chen J,Chen X,Chia N,O'Connor HM,Wolf PG等。慢性便秘女性患者微脑粘膜菌和症状,结肠交通和甲烷生产之间的关系。胃肠病学。2016; 150(2):367.E1-379.E1。https://doi.org/10.1053/j.gastro.2015.10.005

    文章谷歌学术搜索

  10. 10.

    Olsson LM, Poitou C, Tremaroli V, Coupaye M, Aron-Wisnewsky J, Backhed F, et al.;患有普瑞德-威利综合征的肥胖受试者的肠道菌群与代谢健康有关。肠道》2019。https://doi.org/10.1136/gutjnl-2019-319322

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  11. 11.

    关键词:聚类,聚类,聚类,聚类普瑞德-威利症候群作为人类暴饮暴食的模型。Front Horm res 2014; 42:93-106。https://doi.org/10.1159/000358317

    文章PubMed谷歌学术搜索

  12. 12.

    Alyousif Z, Miller JL, Sandoval MY, MacPherson CW, Nagulesapillai V, Dahl WJ。的影响双歧杆菌animalisssp。lactis B94对普瑞德-威利综合征成人胃肠道健康的影响:随机对照试验的研究方案试验。2018;19(1):256。https://doi.org/10.1186/s13063-018-2648-x

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  13. 13.

    MacPherson, Mathieu O, Tremblay J, Champagne J, Nantel A, Girard SA等。健康成年人经短期阿莫西林-克拉维酸治疗后,肠道细菌微生物群及其抵抗体迅速恢复到基础状态水平。Sci众议员2018;8(1):11192。https://doi.org/10.1038/s41598-018-29229-5

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  14. 14.

    Lewis ED, Antony JM, Crowley DC, Piano A, Bhardwaj R, Tompkins TA等。的功效乳酸菌paracaseiHA-196和双歧杆菌longumR0175在缓解肠易肠综合征(IBS)的症状:随机安慰剂对照研究。营养素。2020。https://doi.org/10.3390/nu12041159

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  15. 15.

    关键词:福特,钢琴,纳古勒斯皮莱,Auger J,等。一项随机、双盲、安慰剂对照研究:低剂量和高剂量多菌种益生菌补充剂对普通成人人群微生物群的安全性和效果J饮食增刊,2020年。https://doi.org/10.1080/19390211.2020.1749751

    文章PubMed谷歌学术搜索

  16. 16.

    等。关键词:汽车;含或不含益生元、益生菌和共生素的高蛋白饮食对微生物群稳定性和胃肠道耐受性的影响:一项随机、双盲、安慰剂对照试验。中国营养学会。2020;120(4):500-16。https://doi.org/10.1016/j.jand.2019.12.009

    文章PubMed谷歌学术搜索

  17. 17.

    Bolyen E, Rideout JR, Dillon MR, Bokulich NA, Abnet CC, al - ghalith GA等。使用Qiime 2的可再生,交互,可扩展和可扩展和可扩展的微生物组数据科学.NAT Biotechnol。2019; 37(8):852-7。https://doi.org/10.1038/s41587-019-0209-9

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  18. 18.

    Bokulich Na,Subramanian S,Faith Jj,Goders D,Gordon Ji,Knight R等。质量滤波极大地改善了Illumina扩增子测序的分集估计。NAT方法。2013; 10(1):57-9。https://doi.org/10.1038/nmeth.2276

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  19. 19.

    Bolyen E, Rideout JR, Dillon MR, Bokulich NA, Abnet CC, al - ghalith GA等。QIIME 2:可重复、交互、可扩展和可扩展的微生物组数据科学。PeerJ预印本》2018。https://doi.org/10.1038/s41587-019-0209-9

    文章谷歌学术搜索

  20. 20.

    Vázquez-Baeza Y, Pirrung M, Gonzalez A, Knight R. EMPeror:一个可视化高通量微生物群落数据的工具。Gigascience。2013;2(1):16。https://doi.org/10.1186/2047-217X-2-16

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  21. 21.

    vázquez-baeza y,gonzalez a,smarr l,mcdonald d,mortonjt,navas-molina Ja,等。用动画带来动态的微生物队。细胞宿主微生物。2017; 21(1):7-10。https://doi.org/10.1016/j.chom.2016.12.009

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  22. 22.

    麦当劳D,Clemente Jc,Kuczynski J,Rideout Jr,Stombaugh J,Wendel D等。生物观察矩阵(BIOM)格式或:我如何学会停止令人担忧,热爱OME-OME。傻瓜。2012; 1(1):7。https://doi.org/10.1186/2047-217X-1-7

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  23. 23.

    Katoh K,Standley DM。Mafft多序列对齐软件版本7:性能和可用性的提高。mol Biol Evol。2013; 30(4):772-80。https://doi.org/10.1093/molbev/mst010

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  24. 24.

    Lozupone C,Knight R. Unifrac:一种用于比较微生物群落的新系统发育方法。申请环境微生物。2005; 71(12):8228-35。https://doi.org/10.1128/aem.71.12.8228-8235.2005

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  25. 25.

    beta多样性的定量和定性测量导致了对微生物群落结构因素的不同见解。应用环境微生物学。2007;73(5):1576-85。https://doi.org/10.1128/AEM.01996-06

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  26. 26.

    张Q,栾y,Sun F.方差调整加权Unifrac:一种强大的β多样性测量,用于比较基于系统发育的社区。BMC生物素。2011; 12:118。https://doi.org/10.1186/1471-2105-12-118

    文章谷歌学术搜索

  27. 27.

    Chen J,Bittinger K,Charlson Es,Hoffmann C,Lewis J,Wu Gd等。将微生物组合物与环境协变量相关联使用广义的无摩托车距离。生物信息学。2012; 28(16):2106-13。https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts342

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  28. 28.

    mcmcdonald D, Vázquez-Baeza Y, Koslicki D, McClelland J, Reeve N, Xu Z等。条纹UniFrac:使微生物组分析在前所未有的规模。Nat方法。2018;(11):847 - 8。https://doi.org/10.1038/s41592-018-0187-8

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  29. 29.

    Xu ZZ, Weiss S, pedada S, Amir A, Bittinger K, Gonzalez A等。标准化和微生物差异丰度策略取决于数据特征。微生物。2017;5(1):27。https://doi.org/10.1186/S40168-017-0237-Y.

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  30. 30.

    Amir A, McDonald D, Navas-Molina JA, Kopylova E, Morton JT, Xu ZZ等。Deblur快速解决单核苷酸群落序列模式。mSystems。2017.https://doi.org/10.1128/mSystems.00191-16

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  31. 31.

    细菌系统学中的核酸技术。奇切斯特:威利;1991.

    谷歌学术搜索

  32. 32.

    Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK等。QIIME允许分析高通量社区测序数据。Nat方法。2010;7(5):335 - 6。https://doi.org/10.1038/nmeth.f.303

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  33. 33.

    python统计计算的数据结构。见:第九届Python科学会议论文集,奥斯汀,TX;2010.

  34. 34.

    Legendre P, Legendre LF。数字生态。阿姆斯特丹:爱思唯尔;2012.

    谷歌学术搜索

  35. 35.

    关键词:大数据集,主成分分析,主成分分析计算机科学与技术。2011;33(5):2580-94。

    文章谷歌学术搜索

  36. 36.

    快速树2 -近似极大似然树用于大型队列。PLoS ONE。2010.https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009490.

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  37. 37.

    IACOB S,IACOB DG。传染性威胁,肠道障碍,及其特洛伊木马:脱泻病。前微生物。2019; 10:1676。https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01676

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  38. 38.

    彭勇,谭青,Afhami S, dehan EC, Liang S, Gantz M,等。普瑞德-威利综合征患儿的肠道菌群。基因。2020。https://doi.org/10.3390/genes11080904

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  39. 39.

    曾强,李丹,何勇,李勇,杨智,赵旭,等。不同的肠道微生物群标记物用于肥胖相关代谢异常的分类。Sci众议员2019;9(1):13424。https://doi.org/10.1038/s41598-019-49462-w

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  40. 40.

    何勇,吴伟,吴珊,郑惠明,李鹏,盛海峰,等。基于种群水平的分析将肠道微生物群、代谢综合征和经济状况联系起来。微生物。2018;6(1):172。https://doi.org/10.1186/s40168-018-0557-6

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  41. 41.

    Menni C,杰克逊Ma,Pallister T,Steves CJ,Spector Td,Valdes Am。肠道微生物多样性和高纤维摄入量与较低的长期体重增加有关。in j obes。2017; 41(7):1099-105。https://doi.org/10.1038/ijo.2017.66

    CAS文章谷歌学术搜索

  42. 42.

    kaakoush no。洞察erysipelotrichaceae在人类宿主中的角色见解。前细胞感染微生物。2015; 5:84。https://doi.org/10.3389/fcimb.2015.00084

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  43. 43.

    Liu Y, Ajami NJ, El-Serag HB, Hair C, Graham DY, White DL,等。膳食质量和结肠黏膜相关肠道微生物组在人类。Am J clinclinnutr . 2019;110(3): 701-12。https://doi.org/10.1093/ajcn/nqz139

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  44. 44.

    Ottsons F,Brunkwall L,Ericson U,Nilsson PM,Almgren P,Fernandez C等人。与BMI相关的血浆代谢物型和肠道微生物之间的连接。J Clin Endocrinol metab。2018; 103(4):1491-501。https://doi.org/10.1210/jc.2017-02114

    文章PubMed谷歌学术搜索

  45. 45.

    (1) Ozato N, Saito S, Yamaguchi T, Katashima M, Tokuda I, Sawada K等。在20-76岁的成年人中与内脏脂肪积累相关的白毛属。NPJ bioofilms microbiome . 2019;5:28。https://doi.org/10.1038/s41522-019-0101-x

    CAS文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  46. 46.

    Sode-Carlsen R, Farholt S, Rabben KF, Bollerslev J, Schreiner T, Jurik AG等。成人Prader-Willi综合征患者的身体组成、内分泌和代谢概况。生长激素IGF Res. 2010;20(3): 179-84。https://doi.org/10.1016/j.ghir.2009.12.004

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  47. 47.

    Crino A,Grugni G.糖尿病患者的更新和Prader-Willi综合征中的葡萄糖代谢改变。Curr Diab Rep。2020; 20(2):7。https://doi.org/10.1007/s11892-020-1284-5

    文章PubMed谷歌学术搜索

  48. 48.

    Lippert K,Kedenko L,Antonielli L,Kedenko I,Gemeier C,Leitner M等。Gut Microbiota消带病与葡萄糖代谢紊乱和老年人代谢综合征相关。优选微生物。2017; 8(4):545-56。https://doi.org/10.3920/BM2016.0184

    CAS文章PubMed谷歌学术搜索

  49. 49.

    人类肠道微生物群的宏量营养素代谢:主要发酵副产品及其对宿主健康的影响。微生物。2019;7(1):91。https://doi.org/10.1186/s40168-019-0704-8

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  50. 50.

    一项观察性研究表明,运动和运动特定饮食的组合与肠道微生物群的特征有关。J Int Soc Sports Nutr. 2019;16(1):21。https://doi.org/10.1186/s12970-019-0290-y

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  51. 51.

    Laatikainen R,Jalanka J,Loponen J,Hungisto Sm,Hillila M,Koskenpato J,et al。随机临床试验:低FODMAP黑麦面包与常规黑麦面包对肠肠综合征患者肠道微生物的影响:与个别症状变异相关。BMC Nutr。2019; 5:12。https://doi.org/10.1186/s40795-019-0278-7

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  52. 52.

    Priano L, Miscio G, Grugni G, Milano E, Baudo S, Sellitti L,等。普瑞德-威利综合征感觉损伤和疼痛知觉改变的起源:一项神经生理学研究。欧洲疼痛杂志。2009;13(8):829-35。https://doi.org/10.1016/j.ejpain.2008.09.011

    文章PubMed谷歌学术搜索

  53. 53.

    Hanifi A, Culpepper T, Mai V, Anand A, Ford A, Ukhanova M等。评价枯草芽孢杆菌R0179关于胃肠道活力和一般健康:一项在健康成年人中进行的随机、双盲、安慰剂对照试验。Benef微生物。2014;6(1):19-27。https://doi.org/10.3920/BM2014.0031

    文章谷歌学术搜索

下载参考

确认

没有任何。

资金

Lallemand健康解决方案公司资助了这项分析。资助方聘请TAT和JA参与分析、解读数据、撰写稿件的设计。ZA获得了沙特阿拉伯文化使团(SACM)阿卜杜拉国王奖学金项目的博士奖学金。

作者信息

从属关系

作者

贡献

ZA、WJD和JM对PWS的粪便收集进行了初步研究。JA, TAT和WJD设计了分析。JA和TAT对数据进行分析。WJD和JA写的手稿。所有作者阅读并批准最终稿件。

相应的作者

对应于温迪·j·达尔

道德声明

伦理批准和同意参与

该研究议定书由佛罗里达大学的机构审查委员会批准,并被视为对De-Identified样本和豁免(IRB202002813)的非人类研究,因此不适用的同意。

同意出版物

不适用。

利益争夺

JA和Tat是Lallemand Health Solutions Inc.的研究组Rosell Microbiome和益生菌研究室的员工,该分析的资助者。WJD,ZA和JLM声明没有利益冲突。

额外的信息

出版商的注意

188金宝搏牛牛技巧Springer Nature在发表地图和机构附属机构中的司法管辖权索赔方面仍然是中立的。

补充信息

附加文件1:图S1。

所有纳税群体的Pirateplots合并数据集团包括:(a)居住在加拿大的成年人;(b)成年人居住在加拿大,(c)居住在佛罗里达州,美国D)居住在佛罗里达州和PWS的大型女性的成年人与Prader-Willi综合征。

权利和权限

开放获取本文是基于知识共享署名4.0国际许可,允许使用、共享、适应、分布和繁殖在任何媒介或格式,只要你给予适当的信贷原始作者(年代)和来源,提供一个链接到创作共用许可证,并指出如果变化。本文中的图像或其他第三方材料包括在文章的创作共用许可中,除非在材料的信用线中另有说明。如果材料没有包含在文章的创作共用许可证中,而您的预期使用不被法律法规允许或超过允许的使用,您将需要直接获得版权持有人的许可。如欲浏览本许可证的副本,请浏览http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/.“创作共用公共领域”豁免书(http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)适用于本文中提供的数据,除非另有用入数据的信用额度。

再版和权限

关于这篇文章

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引用这篇文章

达尔,w。J。奥杰,J。阿优素夫,Z。et al。Prader-Willi综合征的成年人展示独特的微生物群。BMC Res笔记14,51(2021)。https://doi.org/10.1186/s13104-021-05470-6

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关键字

  • PRADER-WILLI综合症
  • RF39.
  • Blautia
  • Tenericutes
  • 微生物群
  • 16S RRNA